乙型肝炎在撒哈拉以南的非洲高度流行。70％-90％的人口中存在过先前的乙型肝炎感染的血清学证据。这种疾病的负担是巨大的：在非洲男性中，原发性肝癌的死亡率在癌症死亡中排名第一或第二。肝脏的原发癌是％致命的，在35-45岁的平均年龄时会致死，导致家庭在其一生中最富有生产力的时期失去父母和打工仔。据估计，在撒哈拉以南非洲，每年约有50,例乙型肝炎相关性肝硬化死亡，约13万例乙型肝炎相关性原发性肝癌死亡。乙型肝炎疫苗可有效预防儿童乙型肝炎感染。尽管感染率很高且疾病负担很大，但只有少数非洲国家与其他儿童疾病疫苗一样常规使用乙肝疫苗。
